工商管理学院前身为南京经济学院工商管理系，成立于1993年6月，2003年更名为工商管理学院。学院下设工商管理、人力资源管理、旅游管理三个系和一个综合实验教学中心，现有全日制本科生1171人。

以学院为重要支撑的工商管理一级学科已于2011年、2014年、2018年连续入选江苏省优势学科建设项目；企业管理二级学科为江苏省重点学科，是学校首批硕士学位授权点之一，于2004年开始招收硕士研究生；旅游管理、技术经济及管理两个二级学科是学校重点学科，于2012年开始招收硕士研究生。旅游管理专硕（MTA）于2018年获批招生。学院是学校MBA教育的重要支撑学院，也是2002年教育部第一批9所创业教育试点高校的依托学院之一。

学院设置有“工商管理”、“人力资源管理”、“旅游管理”和中外合作办学“工商管理（环境商务）”四个本科专业。其中，工商管理专业、旅游管理专业入选国家级一流本科专业建设点，人力资源管理专业入选江苏省一流本科专业建设点。根据武书连版全国专业评估结果，旅游管理于2018、2019和2020连续三年为B+等级，2020年人力资源管理达B+等级，工商管理专业为B等级。在2022年“软科中国大学专业排名”中，我院三个专业均被评为A等级。工商管理、人力资源管理和旅游管理均顺利通过江苏省高校本科专业综合评估。“工商管理（环境商务）”专业是学院与加拿大滑铁卢大学环境学院合办，采取“3+2”人才培养模式，是南京财经大学通过教育部审核批准的第一个中外合作办学项目，该项目2020年顺利通过教育部中外合作办学专业区域评估。