土木工程学科瞄准国际学术前沿，紧密结合国家与地方重大工程建设需求，通过60多年的不懈努力，已建立起学术队伍整齐、研究特色鲜明的学科体系，研究内容涉及结构工程、岩土工程、防灾减灾工程及防护工程、桥梁与隧道工程、市政工程、供热、供燃气、通风及空调工程六个二级学科硕士学位授权领域，结构工程、岩土工程、防灾减灾工程及防护工程、桥梁与隧道工程学科建制在土木工程学院，市政工程、供热、供燃气、通风及空调工程学科建制在能源与环境工程学院。本培养方案的执行单位为土木工程学院。

1990年批准设立结构工程硕士点，2006年批准设立防灾减灾工程及防护工程以及供热供燃气通风及空调工程硕士点，2010年获得土木工程一级学科硕士授权，目前已培养研究生600多名。结构工程是内蒙古自治区首批工学硕士点，为自治区重点培育学科，防灾减灾工程及防护工程为内蒙古科技大学重点学科。土木工程学科拥有院士工作站、自治区重点实验室、自治区工程技术研究中心三个科研平台，土木工程本科专业为国家级一流专业，土木工程实验教学中心为内蒙古自治区实验教学示范中心。本学科目前有研究生导师29人，其中博士生导师3人。

经过多年的建设和发展，本学科已形成了以钢与混凝土组合结构、钢结构及大跨度空间结构、混凝土结构耐久性、新型混凝土材料、工程结构振动与控制、结构损伤诊断与加固、城市地下结构施工理论与技术等为核心的主要研究领域。毕业生可在结构工程、岩土工程、防灾减灾工程及防护工程、桥梁与隧道工程从事结构设计、施工新技术研发、教学、科研等工作。