政府管理学院的学科渊源可以追溯到1921年成立的国立东南大学、中央大学政治学系和1924年成立的私立金陵大学政治学系，至今已有近百年的历史。1986年，南京大学复建政治学系，之后于2002年成立公共管理学院，2009年更名为政府管理学院。经过复建后30余年的改革发展，学院在学科建设、人才培养、队伍建设、科学研究、社会服务等方面取得了显著成就，现已成为国内高校中实力较强和特色鲜明的政治学和公共管理研究重镇之一。

学院现设有政治学系、行政管理系、劳动人事与社会保障系等教学单位，设有3个本科专业（政治学与行政学、行政管理、劳动与社会保障），行政管理专业为第六批全国高校特色专业、国家一流本科专业建设点；拥有2个一级学科博士点（政治学、公共管理），2个博士后流动站（政治学、公共管理），2个江苏省一级学科博士点重点学科（政治学、公共管理），2个江苏省优势学科（政治学、公共管理），1个专业硕士学位授权点（公共管理硕士，MPA）。学院还拥有1个江苏省哲学社会科学研究基地（江苏省社会风险管理研究基地暨南京大学社会风险与公共危机管理研究中心），1个江苏省高校哲学社会科学重点研究基地（公共事务与地方治理研究中心），1个江苏省高校哲学社会科学重点建设基地（社会保障研究中心），1个江苏省决策咨询研究基地（江苏基层组织建设研究基地），一个中央部委研究基地（民政部政策理论研究基地）；学院与海外多个世界著名高校开展了双硕士学位项目及多个交换生项目。