上海海事大学MBA教育始于1996年。该年，经国务院学位委员会批准，海大经济管理学院与荷兰马斯特里赫特管理学院（MSM）开始合作举办MBA项目。1998年，经国务院学位委员会批准，学院独立试办MBA教育。2001年，学院通过了国务院学位办组织的全国MBA教育合格评估，并取得全国综合评估第三名的好成绩，受权开始正式举办MBA教育（全国第三批）。2002年，学院与MSM合作举办的MBA项目获得AMBA认证。2014年，学院成为AACSB（国际高等商学院协会）会员。

上海海事大学MBA以供应链物流的工商管理教育为主要品牌，重点突出港航优势，兼顾综合管理教育。众多的上海海事大学MBA毕业生已成为大型企业尤其是航运、港口和物流企业的CEO、CFO、CLO及其他高层管理人员。海大MBA教育中心被誉为“航运界的黄埔军校”。截止2021年6月，我校累计招收MBA学员5000余人，已获得学位4800余人，境外合作办学MBA近600人，如今，数千名海大MBA/EMBA校友活跃在各行各业的管理岗位上，一批优秀毕业生已走上重要领导岗位，为国家经济建设贡献着自己的力量。