学校起步于1946年7月东北银行总行举办的银行干部训练班，经历了东北银行干部学校、东北银行专门学校、中国人民银行长春银行学校、吉林财贸学院、吉林省财贸学校等几个历史时期，1978年5月恢复吉林财贸学院，1992年5月更名为长春税务学院，2010年3月更名为吉林财经大学。学校是我党在东北创办的红色金融教育基地，是新中国创建的第一所金融高等学校，是国家较早成立的普通本科财经院校之一，是国家第一所、也是唯一一所税务本科大学。

2005年，学校整体搬迁至被誉为“亚洲第一大人工林海”的净月潭畔，校园占地面积108万平方米。收藏纸质图书166万册，电子图书127万册，外文原版期刊84种，中外文数据库63个。自然、典雅、厚重、博大的校园环境和宽敞、明亮、向阳、舒适的学生公寓，为莘莘学子成长成才创造了良好的条件。在软科2021年大学排名中，位列财经类大学排名第23；在校友会2021吉林省大学排名中，位列第9。